MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 92

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017776	TTTG	2	8	18	25	0 %	75 %	25 %	0 %	386644996
2	NC_017776	ATG	2	6	120	125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386644996
3	NC_017776	A	6	6	169	174	100 %	0 %	0 %	0 %	386644996
4	NC_017776	TCA	2	6	175	180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386644996
5	NC_017776	AAG	2	6	234	239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386644996
6	NC_017776	TA	3	6	328	333	50 %	50 %	0 %	0 %	386644996
7	NC_017776	GTA	2	6	369	374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386644996
8	NC_017776	T	6	6	410	415	0 %	100 %	0 %	0 %	386644996
9	NC_017776	GAA	2	6	461	466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386644997
10	NC_017776	TTG	2	6	482	487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386644997
11	NC_017776	AAG	2	6	489	494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386644997
12	NC_017776	CTT	2	6	531	536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386644997
13	NC_017776	CAA	2	6	603	608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386644997
14	NC_017776	T	6	6	629	634	0 %	100 %	0 %	0 %	386644997
15	NC_017776	GCTTC	2	10	635	644	0 %	40 %	20 %	40 %	386644997
16	NC_017776	ATGA	2	8	647	654	50 %	25 %	25 %	0 %	386644997
17	NC_017776	ATA	2	6	677	682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386644997
18	NC_017776	TGAT	2	8	723	730	25 %	50 %	25 %	0 %	386644997
19	NC_017776	TTA	2	6	765	770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386644997
20	NC_017776	AAT	2	6	773	778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386644997
21	NC_017776	GA	3	6	923	928	50 %	0 %	50 %	0 %	386644998
22	NC_017776	TGG	2	6	943	948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386644998
23	NC_017776	AGA	2	6	969	974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386644998
24	NC_017776	AAAAC	2	10	975	984	80 %	0 %	0 %	20 %	386644998
25	NC_017776	CGT	2	6	1037	1042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386644998
26	NC_017776	A	6	6	1075	1080	100 %	0 %	0 %	0 %	386644998
27	NC_017776	AT	3	6	1085	1090	50 %	50 %	0 %	0 %	386644998
28	NC_017776	GGT	2	6	1118	1123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386644998
29	NC_017776	ACA	2	6	1130	1135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386644998
30	NC_017776	AGA	2	6	1174	1179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386644998
31	NC_017776	CAA	2	6	1221	1226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386644998
32	NC_017776	GA	5	10	1228	1237	50 %	0 %	50 %	0 %	386644998
33	NC_017776	GGT	2	6	1238	1243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386644998
34	NC_017776	GT	4	8	1325	1332	0 %	50 %	50 %	0 %	386644998
35	NC_017776	TTA	2	6	1411	1416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386644998
36	NC_017776	GAG	2	6	1454	1459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386644998
37	NC_017776	GAT	2	6	1505	1510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386644998
38	NC_017776	TTG	2	6	1593	1598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386644998
39	NC_017776	TAG	2	6	1639	1644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386644998
40	NC_017776	TC	3	6	1795	1800	0 %	50 %	0 %	50 %	386644998
41	NC_017776	TTATC	2	10	1804	1813	20 %	60 %	0 %	20 %	386644998
42	NC_017776	AAT	2	6	1818	1823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386644998
43	NC_017776	TGT	2	6	1829	1834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017776	A	7	7	1835	1841	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017776	ATT	2	6	1885	1890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017776	N	864	864	1891	2754	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017776	TGA	2	6	2770	2775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017776	A	6	6	3030	3035	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017776	GAT	2	6	3064	3069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386644999
50	NC_017776	AAT	2	6	3088	3093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386644999
51	NC_017776	TAA	2	6	3105	3110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386644999
52	NC_017776	GA	4	8	3214	3221	50 %	0 %	50 %	0 %	386644999
53	NC_017776	AAG	2	6	3238	3243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386644999
54	NC_017776	TAG	2	6	3336	3341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386644999
55	NC_017776	GAAAA	2	10	3378	3387	80 %	0 %	20 %	0 %	386644999
56	NC_017776	ATA	2	6	3440	3445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386644999
57	NC_017776	ACA	2	6	3459	3464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386644999
58	NC_017776	AAT	2	6	3487	3492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386644999
59	NC_017776	GA	3	6	3512	3517	50 %	0 %	50 %	0 %	386644999
60	NC_017776	ATA	2	6	3524	3529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386644999
61	NC_017776	ATAAAA	2	12	3545	3556	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	386644999
62	NC_017776	TGG	2	6	3564	3569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386644999
63	NC_017776	GCAT	2	8	3576	3583	25 %	25 %	25 %	25 %	386644999
64	NC_017776	A	6	6	3606	3611	100 %	0 %	0 %	0 %	386645000
65	NC_017776	T	6	6	3613	3618	0 %	100 %	0 %	0 %	386645000
66	NC_017776	TGATTC	2	12	3670	3681	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386645000
67	NC_017776	GTC	2	6	3721	3726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386645000
68	NC_017776	A	7	7	3748	3754	100 %	0 %	0 %	0 %	386645000
69	NC_017776	TAC	2	6	3766	3771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386645000
70	NC_017776	TGT	2	6	3781	3786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386645000
71	NC_017776	TA	3	6	3812	3817	50 %	50 %	0 %	0 %	386645000
72	NC_017776	GTT	2	6	3854	3859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386645000
73	NC_017776	AGA	2	6	3866	3871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386645000
74	NC_017776	GTG	2	6	3873	3878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386645000
75	NC_017776	AGT	3	9	3880	3888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386645000
76	NC_017776	CAT	2	6	3900	3905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386645000
77	NC_017776	T	7	7	3933	3939	0 %	100 %	0 %	0 %	386645000
78	NC_017776	CATTAG	2	12	4006	4017	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386645000
79	NC_017776	TTA	2	6	4037	4042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386645000
80	NC_017776	TTC	2	6	4090	4095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386645000
81	NC_017776	AT	3	6	4117	4122	50 %	50 %	0 %	0 %	386645001
82	NC_017776	T	6	6	4134	4139	0 %	100 %	0 %	0 %	386645001
83	NC_017776	A	6	6	4183	4188	100 %	0 %	0 %	0 %	386645001
84	NC_017776	ACA	2	6	4265	4270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386645001
85	NC_017776	TGAT	2	8	4401	4408	25 %	50 %	25 %	0 %	386645001
86	NC_017776	ATGAGG	2	12	4419	4430	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	386645001
87	NC_017776	ACT	2	6	4568	4573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386645001
88	NC_017776	ACT	2	6	4577	4582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386645001
89	NC_017776	GTT	2	6	4595	4600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386645001
90	NC_017776	AT	3	6	4711	4716	50 %	50 %	0 %	0 %	386645001
91	NC_017776	AAT	2	6	4810	4815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386645001
92	NC_017776	AGA	2	6	4847	4852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386645001

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.